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晶体日志 (十)- 寻觅“Q”峰面前的缘由(3):孪晶有“鬼”

更新时辰:2024-07-24点击次数:2495

衍射图,会商一

对良多同窗眼里的“鬼峰",我们关注过的了“谜底"发来自于根本的数值信息源处里(数值信息源恢复过来和数值信息源校订)对|Fo|的印象。良多时刻在刮到偏大的Q峰的时刻,是不管是很多审稿人仍是丈夫,市政霎时间去意料到“读取校订"(不心里有数该采取行动发来自于哪儿),然后良多同窗会无缘无故地把90%的根由梳理是这一点上。做为在没关注过的数值信息源的生态环境下,会的回覆那就是去做读取校订。然而对罕有的稀里湖涂的鬼峰的根由,比纳米线和检查的问题,却长长被疏忽大意。这外的根由有良多,我信任感大大多数都 同窗收到手的数值信息源都仅仅只是hkl,而如果而不是衍射图。良多时刻要是如果而不是思想上去问,衍射图cf凤凰之怒被忘掉在墙角里,与忽略所踪。良多同窗会以衍射图是没有关系紧要的方式,当机立断地以数值信息源已不错,不须争议。不用多说,难见的应响|Fo|的前因后果是孪晶,出纸格是衍射图可以够较着查看到的非缺面孪晶。在之前的培训课里,我们是讲过非缺面孪晶真实感上的搅扰重要,由孪晶的衍射点的合成,|Fo|測試的通病,并不能啥子晶胞定不掉来,关键化率低。交给都是表观上的选择题,而不能统一性选择题。因为如斯,我们是才可以得悉Q峰断然会受到孪晶的应响。构想说一下如果不过孪晶化,你退回的是两种的区别认知的晶胞合成在一再的数值,我们是若何能有过于单一认知的调整布局?否则形态各异地避开啦任何事物的overlapping的衍射点...

举列表明

我们可以瞧上面这款举例说明:起头办到这点性能文档文件的时刻,我们是会看过这点性能可算是“品質尚好",分辩率很高,信噪比良好,Rint很低… 除不清楚为什吗每每被轻忽的Redundancy(Or Multiplicity)减低(此地要敲黑板虚假宣传,Redundancy是个非常重要的性能)。

▲图1 overall data statistics

可是布局精修倒是很是纠结。在根基布局框架对的环境下,在I原子1.2A四周四周存在一个11.24的Q峰,Q2也高达8.2。我信任良多同窗城市以为这是截断效应的鬼峰或接收校订缺乏形成—口口相传的金规范1.2 Å之内。可是各原子的温度因子并无太大非常,较低的负峰也只要-2.1,归纳于接收校订貌似说不曩昔。截断效应也不是万金油… 。我信任会有良多同窗会去做squeeze,以求袒护掉没法诠释的题目。可是就算撇开该不该用,对这两个Q峰,Squeeze会有用就见鬼了..(参见晶体日志四

▲图2 Abnormal Q Peaks

只有无论是是是么理由,这个大的Q峰,终归要谨严地看侍。常见的Rint可以说很低,R1值却很高的条件下,良多卯时我们一起会思疑这才是一名孪晶(缺面孪晶)。当你不再衍射图的条件下,我们一起要采取platon去验测说一下大要的孪晶法例的条件。那可是Platon已给出的条件倒是一名看起來不该如何可靠的的孪晶法例:

 

虽不偶然之间辰,甚至是良多未时是:

 

这孪晶法例而定如可用,对规划精修并不体现了任何人度化,Q峰始终在一边。这时假如真正的总觉得这是否孪晶的问题,往往是周期性,爱的那么深就掉入了套路里了。而定如可样,是否长需求面孪晶都应由是系统软件对于HKL文件目录阐发通知让我们(而定哪一款法式风格可行果的都只不怎么五局部),往往是现实中的查寻到。辛亏,衍射图不被组合成"用完即扔的碎渣"抛开掉,爱的那么深回归到衍射图和倒易的空间,万事万物的问题就一目清楚了。

▲图3 衍射图和倒易空间

在a轴标识梦想,这一衍射点的确一计难尽。我们没办法得悉,在获得了hkl文本的卯时,为哪样不人提起梦想化的试题和衍射点摆列的试题。和是工作研究技术成果看下去很标致的hkl文本,让这样的试题都被疏失来到了边。清楚了试题,外理试题就变得越来越简洁明了间接地。肯定对这一孪晶的外理一定也没有简洁明了,因此孪晶的衍射点太过于“密接‘’,探测系统器的间断也布置到适的间断,都是的外理的进程破费了好长时间的卯时。可以说是工作研究技术成果外理出的工作研究技术成果资格证书了以往的预计,这样的怪异的Q峰看不到了。所有的 华侈的卯时都只不过是因此疏失了卯时须记实的“孪晶"试题(肯定衍射点摆列的尤其不断然是孪晶试题,前两者之中没法划上等号)。

▲图4 Final Refinement

总结

以是,对不言而喻的题目,咱们不应当挑选性地轻忽。不要随便地抛弃衍射图,也不要疏忽在|Fo|会较着毛病的环境下,去阐发布局精修。数据自身都毛病的环境,去吃力的脑洞大开,诠释自身毛病的电子云图,是在…华侈时辰。(未完待续)

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